舒沃替尼做伴随诊断NGS,赛默飞的FDA验证数据全公开了!

舒沃替尼做伴随诊断NGS,赛默飞的FDA验证数据全公开了!

《Molecular Diagnosis & Therapy》刊出赛默飞世尔团队的一份注册级验证报告:Oncomine Dx Express 检测(ODxET),一款拿了 FDA 上市前批准(PMA)的 NGS 伴随诊断试剂,阳性符合率(PPA)98.2%、阴性符合率(NPA)100%。

是什么

ODxET 是赛默飞的伴随诊断兼肿瘤全景检测试剂,货号 A54103,跑在 Ion Torrent Genexus Dx 系统上,实现了从核酸提取、建库、测序、分析到出报告全自动,一次上机同时测 DNA 和 RNA。

单核苷酸变异(SNV)、多核苷酸变异(MNV)、插入、缺失、拷贝数变异(CNV),以及 RNA 融合与剪接变异,全都要!

手工操作 20 分钟、全流程最快 24 小时、核酸上样量 10 ng。

主力队列 462 份 FFPE 肿瘤样本覆盖 15 种肿瘤类型,另设 58 份野生型样本做特异性对照;四个专项单比乳腺癌 ERBB2 拷贝数、肺癌 ALK 融合、肺癌与甲状腺癌 RET 融合、肺癌 EGFR 位点。

成绩单

全变异类型合计:PPA 98.2%(586/597),NPA 100.0%。

单核苷酸变异 99.5% / 100%;

插入 100% / 100%;缺失 100% / 100%;

拷贝数变异 94.2% / 99.3%;RNA 变异 95.9% / 100%。

ERBB2 拷贝数 100% / 90.2%;

ALK 融合 100% / 97.6%;

RET 融合 100% / 97.1%。

EGFR 的 T790M、L858R、19del 100% / 94.9%。

58 份野生型样本,一份假阳都没有。

检出限(LoD)以上的变异,所有类别的 PPA 都是 100%。

简单重复序列、同聚物、GC 含量 30% 到 75% 各档,单核苷酸变异的 PPA 在 98.6% 到 100% 之间。

临床

EGFR 20 号外显子插入,用的是舒沃替尼的临床样本——WU-KONG1B 试验(NCT03974022),取 202 份组织样本,其中 200 份按临床试验检测方法筛出的插入阳性;另从商业渠道取阴性人群。最终分析用 150 份插入阳性加 138 份插入阴性。

跟临床试验检测方法比:PPA 97.9%(138/141)、NPA 100%(134/134)、总符合率 98.9%(272/275)。

校正后的阳性预测值和阴性预测值都是 100%。

疗效

终点除了一致性,还有用这套试剂选出来的病人,疗效跟试验人群对不对得上。

舒沃替尼 200 mg 队列 85 人,客观缓解率 46%(39/85);既是试验检测阳性、又是 ODxET 阳性的 58 人,客观缓解率 41%(24/58)。

缓解持续时间,试验人群中位 11.1 个月、72% 维持 6 个月以上;ODxET 阳性人群 9.8 个月、63%。

重现性

重现性试验布在三个中心,每中心两名操作者、两台测序仪、三个试剂批次、两次重复。

1 到 1.5 倍检出限档,单变异位点重现性从 87.3% 到 100%,其中 98.7%(76/77) 大于 90%;升到 2 到 3 倍检出限,18 项评价全部 100%。

批内重复性:DNA 除结直肠癌 BRAF p.V600E 一例(1.29 倍检出限,97.1%)外全部 100%;RNA 里 ROS1 融合与 MET 剪接 100%,ALK 融合 1.21 倍时 94.4%、1.83 倍时 88.9%,RET 融合 1.22 倍时 91.7%,到更高靶标水平全部回到 100%。

“本研究总结的是经 FDA 审评的主要验证数据”。

Cheng A, Nallu S, He L, et al. Analytical and Clinical Validation of the Oncomine Dx Express Test, an In Vitro Diagnostic-Labeled Assay, for Genomic Profiling of FFPE Tumor Samples. *Molecular Diagnosis & Therapy*. 2026. DOI: 10.1007/s40291-026-00884-z

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